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國際首個橡膠草高密度SNP遺傳圖譜出爐
發布時間:2023-03-17 10:24:23 文章來源:科技日報
國際首個橡膠草高密度SNP遺傳圖譜出爐


(資料圖片)

記者3月16日從中國熱帶農業科學院獲悉,該院橡膠所在橡膠草遺傳圖譜構建和含膠量QTL發掘方面取得重要進展,通過全基因組重測序技術構建了國際上首個橡膠草高密度SNP(單核苷酸多態性)遺傳圖譜,并結合作圖群體的含膠量數據,定位了6個含膠量相關QTL(數量性狀位點)。該研究為橡膠草含膠量相關分子標記的開發、分子標記輔助育種和功能基因圖位克隆提供了信息基礎和技術支持。

研究團隊以兩個含膠量差異大的橡膠草株系雜交構建的F1代群體作為作圖群體,利用“雙假測交”策略采用全基因組重測序技術開發SNP標記,基于橡膠草染色體水平上的全基因組信息,成功構建國內外第一個橡膠草高密度SNP遺傳圖譜。該遺傳圖譜由12680個bin構建的9個連鎖群組成,包含322439個SNP。遺傳圖譜的總遺傳距離為34220.75cM,平均遺傳距離2.70cM。結合F1代作圖群體的含膠量數據,利用復合區間作圖法共檢測到6個含膠量相關QTL。其中,在 LG06/ChrA06(第6號連鎖群/第6號染色體)上,具有2個最高LOD(Logarithm of odds)值的QTL彼此接近,解釋了表型貢獻率的48.27%,表明其可能是影響橡膠草含膠量的主要區域,并對該區域包含的基因也進行了初步分析。

天然橡膠是世界四大工業原料之一,巴西三葉橡膠樹一直是天然橡膠的主要來源,但由于種植面積限制、生產成本增加、遺傳背景狹窄和病蟲害嚴重等因素,橡膠生產逐漸難以滿足需求。因此,開發生產天然橡膠的替代資源具有重要的戰略意義和經濟價值。橡膠草又稱俄羅斯蒲公英,其根部橡膠含量高,品質優良,是近年來備受關注的重要產膠作物之一。目前,我國橡膠草種質較少且橡膠草種質的含膠量普遍較低,不能滿足橡膠草產業化發展要求。因此,篩選和創制高含膠量橡膠草是目前主要的育種目標。

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